PageRankはGoogleが用いる指標です。YSTとは関係がありません。
YSTは米Yahoo!が独自に開発した検索技術です。Googleとは全く別の製品ですから、何の関係もありません。
2004/06/02現在、Yahoo! Web Rankの詳細情報が一切ない以上、何とも説明ができません。もしかしたら重要かもしれないし、重要でないかもしれません。
Yahoo!JAPANが採用したのはYahoo! Search Technology(YST)。Inktomiをベースに開発した新たな検索エンジンですので、Inktomiではありません。
アルゴリズム型検索エンジンに対応するという意味でGoogle、YSTの区別はありませんから、別に影響はありません。
GoogleもYSTも同じアルゴリズム型の検索エンジンですからムダになることはありません。例外もありますが。
SEOを理解しているSEO会社にとっては何の影響もありません。よくわかっていないSEO会社が苦労するだけだと思います。